2006年，教育部宣布停止中国防卫科技学院停止招生，并进行整改。2007年，教育部再次宣布停止该校招生，并确认该校在2006年禁招令下达后仍在违规招生。
中国防卫科技学院接受记者采访的几名学生表示，仅仅下发通知，并不能制止学校违规招生，而相关部门没有及时追究中国防卫科技学院的责任造成了他们的有恃无恐。
这些学生向记者出示了2005年9月北京某媒体对中国防卫科技学院违规招收山东艺术类学生的报道。报道称，记者就违规招生问题采访了教育部发展规划司计划处处长楼旭庆，楼处长说，中国防卫科技学院确属公办高校。该校在山东的艺术设计专业招生，规定的计划招生人数为25人，中国防卫科技学院的实际招生数字扩大到500多人，严重超标。“尽管是违规扩招，却已经铸成事实，500多名学生已经被录取，为广大学子的切身利益考虑，教育部还是予以认可，承认其为统招本科。”
记者注意到，同样在2005年，教育部学生司负责人在教育部新闻发布会上提出高考招生工作的四个“决不允许”，其中两条就是，“决不允许学校擅自扩大招生规模，招生计划执行情况一律与学籍电子注册挂钩；决不允许游离于招生工作体系之外录取考生，对未经省级招办录取审核的考生，其入学资格或学籍一律不予承认，所发的毕业证书无效。”
中国防卫科技学院文理学院科技防卫专业2007届毕业生张雷（化名）对记者表示，就中国防卫科技学院计划外招生问题，他咨询了北京市教委，答复是“该校属于教育部管理，请向教育部反映。”
随后，张雷先后3次向教育部信访办反映。信访办最后表示，“你应该和中国远东国际贸易总公司联系。”
张雷说：“中国防卫科技学院说有招生骗子，就向公安机关报案了。我也受骗了，却没人管。这样的学校，不出问题是偶然的，出问题才是必然的！”
